Episomin, alalla genetiikan, on DNA-molekyyli, joka kykenee replikoitumaan autonomisesti sytoplasmassa isäntäsolun, ja että fyysisesti integroitu isäntäsolun kromosomiin, joka replikoituu myös yhtenä molekyylinä (klo jota kutsumme integroituneeksi).
Siksi episomi voidaan tulkita rinnakkaiselon muodona, ei replikonityyppinä. Itse asiassa joillekin kirjoittajille transposoneja ja insertiosekvenssejä voidaan pitää episomeina, koska niitä kuljetetaan tosiasiallisesti isäntäsolun kromosomissa, vaikka heillä ei koskaan ole itsenäistä ja autonomista sytoplasmassa olemassaoloa.
Eukaryoottisoluissa sitä vastoin episomi viittaa enemmän virusreploneihin, jotka esiintyvät samanaikaisesti plasmideina tartunnan saaneissa soluissa, kuin viruksiin, jotka voivat integroitua isäntäsolun genomiin.
Tämä ei ole ainoa tapaus, jossa sama sana tarkoittaa erilaisia asioita eukaryooteissa ja prokaryooteissa (esimerkiksi termi transformaatio). Jaksoilla on rikas historia modernin genetiikan kehityksessä, koska ne auttoivat purkamaan mielenkiintoisia perinnöllisyyteen liittyviä ilmiöitä.
Jakeet, jotka ovat bakteriofageja
Toinen tunnetuimpia esimerkkejä episomeista on hedelmällisyystekijä tai plasmidi F. Joskus isäntäbakteerin (esim. E. coli) nukleotidikoostumuksesta riippuen, pyöreä plasmidi rekombinoi kromosomissa olevien homologisten kohtien kanssa. bakteerista, joka synnyttää yhdentymisen.
Toisin sanoen, plasmidi voi replikoitua pienellä kopiolukumäärällä bakteerin sytoplasmassa, tai jos se on integroitunut, replikoitua kokonaisuutena kopiomääränä, joka vastaa bakteerin ilman F: tä (yleensä yksi).
Jakson tilassa F antaa bakteereille kyvyn tuottaa suuri määrä rekombinantteja konjugaatioprosessin jälkeen.
F + -bakteerin (ts. Jolla on itsenäinen F-plasmidi), joka käy läpi tämän elementin insertoinnin, sanotaan olevan Hfr (rekombinaation korkealle taajuudelle, sen lyhenteen englanniksi), koska konjugaatiotapahtuman vuoksi se on teoreettisesti kykenevä "vetämään" koko bakteerikromosomin F-bakteeriin (ts. josta puuttuu hedelmällisyyskerroin tai plasmidi F).
Yleensä sekvenssit, jotka tarjoavat homologian (ja siten samankaltaisuuden ja komplementaarisuuden) F-plasmidin ja bakteerikromosomin välillä siten, että paikka-spesifinen rekombinaatioprosessi, joka antaa yhteisintegraatin, varmennetaan, ovat insertiosekvenssejä.
Jaksot eukaryoottisoluissa
Historiallisista syistä termi episomi (+ ruumiin yläpuolella) yhdistettiin aina plasmidin käsitteeseen, joka alun perin johtuu prokaryoottien kromosomivälisten elementtien maailmasta.
Kun löydettiin samankaltaisia elementtejä eukaryooteissa, hyväksyttiin niiden käyttäminen virusgenomien molekyylien nimeämiseksi, jotka kykenevät itse replikoitumaan tämän tyyppisissä tartunnan saaneissa soluissa ja joiden ominaisuudet olivat samankaltaiset kuin prokaryoottien plasmidit.
Toisin sanoen viruksilla infektoiduissa eukaryoottisoluissa voimme havaita joissain tapauksissa, että virus esiintyy osana replikaatiosykliään solussa ympyränmuotoisena DNA-molekyylinä, joka on samanlainen kuin nämä muut replikonit, joita kuvataan esimerkiksi bakteereissa.
Yleisimmin tunnetut virukset, jotka voivat esiintyä rinnakkain itsenäisesti replikoivina pyöreinä DNA-molekyyleinä (isäntäkromosomista), kuuluvat Herpesviridae-, Adenoviridae- ja Polyomaviridae-perheisiin.
Mikään niistä ei kuitenkaan ole integroitunut isäntägenomiin, minkä vuoksi voidaan katsoa, että ne replikoituvat plasmideina ja että ne eivät täytä episomille ominaista sisäistä laatua: integroituvat isännän genomiin.
Vaikka termin ehdottamista on ehdotettu, se lisää ehkä sekaannusta aiheeseen, joka on jo itsessään melko monimutkainen.
johtopäätökset
Yhteenvetona voidaan sanoa, että episomi, etymologisesti ottaen, on autonomisen replikaation geneettinen elementti, joka voi esiintyä solussa rinnakkain vapaana DNA-molekyylinä tai fysikaalisesti integroituna isännän vastaavaan.
Genetiikan näkökulmasta episomi on kuitenkin plasmidi tai virus, joka voi integroitua prokaryoottiseen genomiin, tai olla yksi plasmidityypeistä, joita eukaryoottisolu voi pitää satamassa.
Mielenkiintoista, että viruksia, joita voidaan insertoida eukaryoottisen isännän genomiin (retrovirus), ei pidetä jaksoina.
Viitteet
- Brock, TD 1990. Bakteerigenetiikan esiintyminen. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, MA, Yhdysvallat.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. Johdatus geneettiseen analyysiin. WH Freeman & Co, McMillan kustantajat. Lontoo Yhdistyneet kuningaskunnat.
- Hayes, W. 1971. Bakteerien ja niiden virusten genetiikka, toinen painos. Blackwellin tieteelliset julkaisut.
- Jacob, F. & Wollman, EL 1958. Les episomes, elements génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Virology, 3. painos. Prentice Hall. Englerwood Cliffs, NJ, Yhdysvallat.